中岩寺位于思明区万石植物园内，因处万石莲寺与太平岩之间而得名。据传说，中岩寺始建于明代，但具体的年代已经不可考。有一段时间，这里住着一位不知名的僧人，他隐居在中岩，修炼定力，鹧鸪鸟在他的周围飞翔和栖息。后来这位僧人不知所终，当地人因此称这里为“鹧鸪岩”。后来又有僧人在岩前建造了招提寺，称为“云中岩”。

清康熙五十三年（1714年），僧人释果老重兴中岩。道光五年（1825年），因为寺宇年久失修，成立了董事会重新修葺。但在修建过程中，遭遇了蚁患，工程遂中止。道光十九年（1839年），堪舆家安溪驷岭林嘉缠妙手回春，改造了环境，根治了蚁患。光绪四年（1878年），山僧绍觉重修第一道山门，并在门柱上集晋人诗句题联：“结庐在人境，流心叩玄扃”。

民国元年（1912年），中岩董事邀请老年友人成立老年会，每逢星期日登临远眺。十一年后，会所倾颓，老年会捐资修筑并添置产业。十三年，会泉法师倡议修葺中岩佛堂寮舍，其皈依弟子蒋以德捐资襄赞。

解放前后，中岩寺景况萧然，后来佛宇禅房尽塌。直到20世纪90年代，中岩寺开始重兴。先是由万石岩寺筹资赎回，后由宏船徒弟广载捐献巨资进行重建。一九九五年，开悟法师发心对寺院进行全面复兴扩建。

目前的中岩寺有大雄宝殿、地藏殿、龙华三会殿、祖堂、功德堂、综合楼、僧舍、三宝塔等建筑，总建筑面积一千二百平方米。寺内还有“玉笏”和“澎湖阵亡将士祠碑”等文物，于1984年被公布为厦门市第二批文物保护单位。

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